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PCR實驗室主要實驗項目：病毒檢測，乙型肝炎，禽疫病，癌基因的檢測和診斷，DNA指紋，個體識別，親子鑒定及法醫物證等等。
PCR實驗室建設原則上分為四個單獨的工作區域：試劑貯存和準備區、標本制備區、擴增反應混合物配制和擴增區、擴增產物分析區。
1、試劑準備區：用于試驗試劑的準備。
該區域為正壓，目的是防止污染物質溢入。該區域內部又可分為3個區域：普通提取試劑的準備區、PCR試劑準備區和PCR主反應液準備區。在普通提取試劑的準備區內準備一些樣品核酸提取時所需的裂解液、提取液等；PCR試劑準備區用于PCR試劑的制備和保存。例如準備引物、探針等PCR試劑。為了防止交叉污染，避免反復冷凍和解凍，試劑存貯溶液應該被平均為小的工作體積，儲存在這個房間以備后用：PCR主反應液準備區將進行主反應混合液(除了樣品。所有PCR所需試劑的混合)添加到PCR管的操作。重要提示：不能將其它房間的材料(包括擴增、模板和目標核酸或陽性對照、供應品、或設備)帶進試劑準備區。
2、樣品準備區：該區域無壓力設置要求。
該區域是用于對樣品進行分樣，將樣品進行研磨、粉碎、勻漿的區域。由于在這些粉碎、研磨和勻漿處理過程中會產生氣溶膠，因此，存在陽性樣品污染后續操作的可能性。該區域與后面的區域應嚴格隔離，應放在與后面的三個區域隔開的獨立的房間中。在樣品準備區內還可設立一個專用的封閉區或房間用于樣品的接收和儲存。這個房間可以放置冰箱用于樣品儲存，應該和樣品準備區其它區域隔離開。樣品準備區域的人員不得進入試劑準備區。
3、核酸提取區：核酸提取區是進行樣品核酸提取的區域。
該區域為負壓，目的是防止核酸溢出造成污染。樣品準備區又包括從樣品中進行核酸提取和純化的區域以及將核酸加到包含PCR主反應混合液管中的操作區域。添加完樣品后，PCR管的蓋子要盡可能快地蓋好。使用PCR板和膠蓋時，陽性對照和含目標序列的樣品要與待測樣本分開操作，以避免模板添加時造成交叉污染
重要提示：這個房間里的一切物品不得帶人試劑準備區。
4、擴增和產品檢測區：該區域是用來進行PCR擴增和PCR分析。
PER儀放置在這個區域。房間保持負壓，目的是防止核酸溢出。在該區域人員一定要一直穿戴工作服和手套，在離開房間前脫去，防止擴增子污染其它地點。所有用于擴增和產品檢測的設備要指定用于這個房間。PCR分析]二作也設置在該區域，例如：酶切、測序、克隆等，但實驗室應盡可能把這些活動分隔在不同區域或不同房間。以降低擴增產物的污染風險。如果沒有條件在該區域設立負壓，此區域必須建立排風裝置。

實驗室可分為兩大功能工作區：核酸擴增前區和核酸擴增后區。
核酸擴增前區域包括試劑制備室和樣品制備室。兩個房間各自獨立，沒有任何空氣互通。兩個房間相對于外部空氣壓力處于正壓狀態。核酸擴增后區域包括擴增區 域和產物分析區域，其可以使用實時熒光PCR儀器、 HIV病毒載量測定器的PCR實驗室組合成一個房間。如果該區域分為兩個房間，則兩個房間也必須各自獨立，不 能有空中互通。后擴增區對外部空氣壓力處負壓狀態。
實驗室根據儀器的功能設置各種工作區域。例如，使用聚合酶聯反應：設置試劑儲存和準備區域、標本制備區域、擴增區域、擴增產物分析區域四個獨立的工作 區域，這是最常用的分區方法。如果需要粉碎樣品，則需要添加樣品破碎區;如果使用實時熒光PCR法：基因擴增區域、基因產物分析區域可以組合在一個房間;采用 標本處理、核酸提取和擴增檢測為一體的自動PCR分析儀，則樣品制備區域、擴增區域、擴增產物分析區域可以組合成一個區域，因此PCR實驗室原則上設置五個區 域或四個區域或三個區域或兩個獨立的工作區域。
實驗室設備是保障工作質量不可或缺的配置。在PCR實驗室設計中，應根據每個實驗室的要求提供不同的儀器和設備，如：離心機、生物安全柜、超潔凈工作臺、電泳（插槽）、電轉儀、雜交箱、水浴箱、 DNA測序儀、酶標儀和洗板機等等。
實驗室作為一種分子生物學技術，可以放大DNA片段，利用DNA基因跟蹤系統更快，更準確地檢測人體內的病毒含量。它為醫學治療提供可靠依據，為人們帶來了先進的、快速的、高效的醫療依據。

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